Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej jest dofinansowane przez Ministerstwo Nauki i szkolnictwa Wyższego w ramach programu Specjalistyczne Urządzenie Badawcze (SPUB)
Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej rozwija się zarówno pod względem wyposażenia jak i dostosowania do aktualnych procedur laboratoryjnych. W 2017 r. Laboratorium uzyskało status Zakładu Inżynierii Genetycznej, nadany przez Ministra Środowiska. Pozwoliło to rozszerzyć zakres prowadzonych badań o mikroorganizmy genetycznie modyfikowane. Badania w Laboratorium ukierunkowane są na nowoczesne technologie materiałowe oraz środowisko naturalne, rolnictwo i leśnictwo. Głównym nurtem badań w ostatnich latach jest owadobójczość Bacillus thuringiensis, badania chitynaz syntetyzowanych przez Bacillus cereus sensu lato, badania jakości żywności, badania mikroorganizmów patogennych.
Kierownik: prof. dr hab. Izabela Święcicka (izabelas@uwb.edu.pl, tel. (857 388 410)
Osoby dedykowane do pracy w Laboratorium:
- mgr Monika Zambrzycka - proteomika (m.zambrzycka@uwb.edu.pl, tel. (857 388 409)
- mgr Grzegorz Zambrowski - genomika (g.zambrowski@uwb.edu.pl, tel. (857 388 409)
- dr Justyna Drewnowska - sekwencjonowanie następnej generacji (j.drewnowska@uwb.edu.pl, tel. (857 388 407)
Aparatura do analiz genomu:
- stacja izolacji kwasów nukleinowych i białek Qiagen
- zestaw elektroforezy kapilarnej do rozdziału kwasów nukleinowych Qiagen
- system do analizy rozdziałów elektroforetycznych fragmentów DNA i plazmidów
- sekwenator 8-kapilarny Applied Biosystem
- zestaw aparatury do sekwencjonowania genomowego PGM Applied Biosystem
- sekwenator wieloskalowy MiniON Oxford Nanopore Technologies
- aparat do elektroforezy DNA w zmiennym pulsowo polu elektrycznym
- stacja Bio-Rad do analiz rozdziałów DNA w żelu agarozowym
- elektroporator
- analizator kwasów nukleinowych i białek 2200 Tape Station Agilent Technologies
Aparatura do analiz transkryptomu:
- spektrofluorymetr Qubit Invitrogen
- PCR Step One Plus RT PCR Applied Biosystem
Aparatura do analiz proteomu:
- chromatograf cieczowy z detektorem UV-VIS i fluorescencyjnym
- spektrofluorymetr do pomiarów chemiluminescencji Hitachi F-7000
- aparatura do elektroforezy 2D Pharmacia
- aparat do wycinania plamek białkowych z żeli i membran SpotCutter Bio-Rad
- system wielu aparatów do analizy rozdziałów elektroforetycznych białek w żelu poliakrylamidowym
- system do rejestracji wyników rozdziałów białek Bio-Rad barwionych różnorodnymi metodami, w tym fluorochromami
Mikroskopia:
- wielofunkcyjny mikroskop świetlny Olympus BX61
- mikroskop odwrócony Zeiss AX10
Katedra Mikrobiologii i Biotechnologii, w obrębie której znajduje się Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej prowadzi badania naukowe w następujących dziedzinach:
Mikrobiologia
* Izolacja i właściwości entomopatogenne środowiskowych szczepów Bacillus thuringiensis.
* Toksyczność Bacillus cereus z produktów spożywczych.
* Mechanizmy sporulacji i kiełkowania bakterii z grupy Bacillus cereus.
* Bioróżnorodność i taksonomia oraz fenotypowa i genotypowa charakterystyka populacji gronkowców dziko żyjących drobnych ssaków.
* Bioremediacja środowisk skażonych
Cytobiochemia
* Mechanizmy funkcjonowania i regulacji kluczowych enzymów izolowanych z tkanek zwierzęcych.
* Zmiany metaboliczne w procesach degeneracji a apoptoza komórek eukariotycznych.
* Modyfikacja aktywności enzymów in vivo.
Biofizyka
* Mechanizm działania nowych przeciwutleniaczy i związków antybakteryjnych wyizolowanych z roślin występujących w Polsce i Azji Środkowej.
* Aktywność biologiczna kompleksów nanocząsteczek złota z taninami w układach komórkowych pod kątem ich potencjalnego zastosowania w medycynie.
* Fizykochemiczna charakterystyka oddziaływania wybranych polifenoli z białkami i lipidami oraz ich aktywność antynowotworowa.
* Strukturalno – funkcjonalna analiza roślinnych seskwiterpenów w aspekcie ich jonoforowych właściwości.
Model mechanizmu nabywania oporności na polieny u Malassezia
Kierownik: dr Urszula Czyżewska
Termin realizacji: 2020-2023
Zmiany w proteomie nasion podczas kiełkowania w odpowiedzi na zanieczyszczenia jonami ołowiu
Kierownik: Aleksandra M. Staszak
Termin realizacji: 2018-2019
Różnice w enzymatycznym systemie chitynolitycznym szczepów Bacillus cereus sensu lato jako konsekwencja adaptacji do ekologicznie odrębnych środowisk
Kierownik: dr Justyna Drewnowska
Termin realizacji: 2017-2020
Dynamika pangenomu i proteomu wybranych przedstawicieli Bacillus cereus sensu lato ze środowiska pierwotnego i zmienionego antropogenicznie
Kierownik: prof. dr hab. Izabela Święcicka
Czas realizacji: 2016-2019
Stres oksydacyjny podczas termogenezy u myszy laboratoryjnych o genetycznie zróżnicowanym poziomie metabolizmu maksymalnego i podstawowego: rola białka UCP1
Kierownik: dr Paweł Brzę
Czas realizacji: 2015-2020
Polimorfizm genetyczny środowiskowych izolatów Bacillus cereus i Bacillus thuringiensis syntetyzujących melaninę
Kierownik: mgr Justyna Drewnowska
Czas realizacji: 2014-2016
Charakterystyka profili białkowych Malassezia pachydermatis w aspekcie diagnostyki z wykorzystaniem elektroforezy dwukierunkowej
Kierownik: mgr Urszula Czyżewska
Czas realizacji: 2014-2017
Bacillus cereus sensu lato - sześć odrębnych czy jeden polimorficzny gatunek bakterii?
Kierownik: dr Marek Bartoszewicz
Czas realizacji: 2012-2016
Wybrane plazmidy entomopatogennego szczepu Bacillus thuringiensis IS5056 – stworzenie podstaw pod produkcję bioinsektycydów
Kierownik projektu: dr hab. Izabela Święcicka
Czas realizacji: 2011-2014
Struktura genetyczna oraz transfer genów w wybranych populacjach Bacillus cereus sensu lato z północno-wschodniej Polski
Kierownik projektu: dr hab. Izabela Święcicka
Czas realizacji: 2011-2014
- sekwencjonowanie DNA metodą Sangera
- sekwencjonowanie genomów bakteryjnych metodą NGS
- profil genetyczny bakterii metodą elektroforezy w zmiennym pulsowo polu elektrycznym (PFGE)
- jedno- i dwukierunkowa elektroforeza białek
* Uniwersytet Medyczny w Białymstoku
* Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie
* Politechnika Białostocka
* Uniwersytet J. Kochanowskiego w Kielcach
* Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej, Lublin
* University of Guanajuato, Meksyk
* Al-Farabi University, Kazachstan
* Uniwersytet w Louvain, Belgia
* Université Libre de Bruxelles, Belgia
* Yanka Kupala State University of Grodno, Białoruś
* Instytut Chemii Organicznej, Akademia Nauk Republiki Uzbekistanu
* P.401362 2012.10.26 BUP 09/2014. Sposób separacji chorobotwórczych bakterii Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa i Staphylococcus aureus oraz grzybów Candida albicans.
* P.433993p. Kompozycja do leczenia zgnilca ziołowego pszczół.
* P.42611: Steroidowa sól imidazoliowa, sposoby jej wytwarzania oraz jej zastosowania.
Lista publikacji będąca wynikiem wykorzystania potencjału Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej znajduje się na stronie Katedry Mikrobiologii i Biotechnologii
Wyślij je na stronę internetową Wydziału Biologii.