Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej jest dofinansowane przez Ministerstwo Nauki i szkolnictwa Wyższego w ramach programu Specjalistyczne Urządzenie Badawcze (SPUB)

Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej rozwija się zarówno pod względem wyposażenia jak i dostosowania do aktualnych procedur laboratoryjnych. W 2017 r. Laboratorium uzyskało status Zakładu Inżynierii Genetycznej, nadany przez Ministra Środowiska. Pozwoliło to rozszerzyć zakres prowadzonych badań o mikroorganizmy genetycznie modyfikowane. Badania w Laboratorium ukierunkowane są na nowoczesne technologie materiałowe oraz środowisko naturalne, rolnictwo i leśnictwo. Głównym nurtem badań w ostatnich latach jest owadobójczość Bacillus thuringiensis, badania chitynaz syntetyzowanych przez Bacillus cereus sensu lato, badania jakości żywności, badania mikroorganizmów patogennych.

Kierownik:  prof. dr hab. Izabela Święcicka (izabelas@uwb.edu.pl, tel. (857 388 410)

Osoby dedykowane do pracy w Laboratorium:
- mgr Monika Zambrzycka - proteomika (m.zambrzycka@uwb.edu.pl, tel. (857 388 409)
- mgr Grzegorz Zambrowski - genomika (g.zambrowski@uwb.edu.pl, tel. (857 388 409)
- dr Justyna Drewnowska - sekwencjonowanie następnej generacji (j.drewnowska@uwb.edu.pl, tel. (857 388 407)

Aparatura do analiz genomu:

• stacja izolacji kwasów nukleinowych i białek Qiagen
• zestaw elektroforezy kapilarnej do rozdziału kwasów nukleinowych Qiagen
• system do analizy rozdziałów elektroforetycznych fragmentów DNA i plazmidów
• sekwenator 8-kapilarny Applied Biosystem
• zestaw aparatury do sekwencjonowania genomowego PGM Applied Biosystem
• sekwenator wieloskalowy MiniON Oxford Nanopore Technologies
• aparat do elektroforezy DNA w zmiennym pulsowo polu elektrycznym
• stacja Bio-Rad do analiz rozdziałów DNA w żelu agarozowym
• elektroporator
• analizator kwasów nukleinowych i białek 2200 Tape Station Agilent Technologies

Aparatura do analiz transkryptomu:

• spektrofluorymetr Qubit Invitrogen
• PCR Step One Plus RT PCR Applied Biosystem

Aparatura do analiz proteomu:

• chromatograf cieczowy z detektorem UV-VIS i fluorescencyjnym
• spektrofluorymetr do pomiarów chemiluminescencji Hitachi F-7000
• aparatura do elektroforezy 2D Pharmacia
• aparat do wycinania plamek białkowych z żeli i membran SpotCutter Bio-Rad
• system wielu aparatów do analizy rozdziałów elektroforetycznych białek w żelu poliakrylamidowym
• system do rejestracji wyników rozdziałów białek Bio-Rad barwionych różnorodnymi metodami, w tym fluorochromami

Mikroskopia:

• wielofunkcyjny mikroskop świetlny Olympus BX61
• mikroskop odwrócony Zeiss AX10

Katedra Mikrobiologii i Biotechnologii, w obrębie której znajduje się Laboratorium Mikrobiologii Stosowanej prowadzi badania naukowe w następujących dziedzinach:

Mikrobiologia 

* Izolacja i właściwości entomopatogenne środowiskowych szczepów Bacillus thuringiensis.
* Toksyczność Bacillus cereus z produktów spożywczych.
* Mechanizmy sporulacji i kiełkowania bakterii z grupy Bacillus cereus.
* Bioróżnorodność i taksonomia oraz fenotypowa i genotypowa charakterystyka populacji gronkowców dziko żyjących drobnych ssaków.
* Bioremediacja środowisk skażonych

Cytobiochemia

* Mechanizmy funkcjonowania i regulacji kluczowych enzymów izolowanych z tkanek zwierzęcych.
* Zmiany metaboliczne w procesach degeneracji a apoptoza komórek eukariotycznych.
* Modyfikacja aktywności enzymów in vivo. 

Biofizyka

* Mechanizm działania nowych przeciwutleniaczy i związków antybakteryjnych wyizolowanych z roślin występujących w Polsce i Azji Środkowej. 
* Aktywność biologiczna kompleksów nanocząsteczek złota z taninami w układach komórkowych pod kątem ich potencjalnego zastosowania w medycynie. 
* Fizykochemiczna charakterystyka oddziaływania wybranych polifenoli z białkami i lipidami oraz ich aktywność antynowotworowa.
* Strukturalno – funkcjonalna analiza roślinnych seskwiterpenów w aspekcie ich jonoforowych właściwości. 
 

Model mechanizmu nabywania oporności na polieny u Malassezia
Kierownik: dr Urszula Czyżewska
Termin realizacji: 2020-2023

Zmiany w proteomie nasion podczas kiełkowania w odpowiedzi na zanieczyszczenia jonami ołowiu
Kierownik: Aleksandra M. Staszak
Termin realizacji: 2018-2019

Różnice w enzymatycznym systemie chitynolitycznym szczepów Bacillus cereus sensu lato jako konsekwencja adaptacji do ekologicznie odrębnych środowisk
Kierownik: dr Justyna Drewnowska
Termin realizacji: 2017-2020

Dynamika pangenomu i proteomu wybranych przedstawicieli Bacillus cereus sensu lato ze środowiska pierwotnego i zmienionego antropogenicznie 
Kierownik: prof. dr hab. Izabela Święcicka
Czas realizacji: 2016-2019

Stres oksydacyjny podczas termogenezy u myszy laboratoryjnych o genetycznie zróżnicowanym poziomie metabolizmu maksymalnego i podstawowego: rola białka UCP1
Kierownik: dr Paweł Brzę
Czas realizacji: 2015-2020

Polimorfizm genetyczny środowiskowych izolatów Bacillus cereus i Bacillus thuringiensis syntetyzujących melaninę
Kierownik: mgr Justyna Drewnowska
Czas realizacji: 2014-2016

Charakterystyka profili białkowych Malassezia pachydermatis w aspekcie diagnostyki z wykorzystaniem elektroforezy dwukierunkowej
Kierownik: mgr Urszula Czyżewska
Czas realizacji: 2014-2017

Bacillus cereus sensu lato - sześć odrębnych czy jeden polimorficzny gatunek bakterii?
Kierownik: dr Marek Bartoszewicz
Czas realizacji: 2012-2016

Wybrane plazmidy entomopatogennego szczepu Bacillus thuringiensis IS5056 – stworzenie podstaw pod produkcję bioinsektycydów
Kierownik projektu: dr hab. Izabela Święcicka
Czas realizacji: 2011-2014

Struktura genetyczna oraz transfer genów w wybranych populacjach Bacillus cereus sensu lato z północno-wschodniej Polski
Kierownik projektu: dr hab. Izabela Święcicka
Czas realizacji: 2011-2014

• sekwencjonowanie DNA metodą Sangera
• sekwencjonowanie genomów bakteryjnych metodą NGS 
• profil genetyczny bakterii metodą elektroforezy w zmiennym pulsowo polu elektrycznym (PFGE)
• jedno- i dwukierunkowa elektroforeza białek